In KIT-Zentren werden Fragestellungen, die von fundamentaler Bedeutung für die Existenz und Weiterentwicklung der Gesellschaft sind, oder Kernfragen, die aus dem Streben nach Erkenntnis resultieren, bearbeitet. KIT-Zentren zeichnen sich durch ein Alleinstellungsmerkmal im wissenschaftlichen Ansatz, in der strategischen Zielsetzung sowie Aufgabenstellung und eine langfristige Perspektive aus. Sie stellen die größten organisatorischen Einheiten im KIT dar.
Folgende KIT-Zentren wurden bzw. werden eingerichtet: